O PEMAT trata essencialmente do aprofundamento e da integração dos saberes disciplinar e pedagógico em Matemática e Ciências, fornecendo aos pós-graduandos elementos para a construção de uma visão crítica, profunda e abrangente, incluindo sua história e epistemologia, bem como ferramentas teóricas e metodológicas que permitam articular esses conhecimentos reflexão sobre a prática docente.